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急性肝炎是整组肝细胞开始凋亡的结果。胆结石里含有大量的病毒物质。侵蚀及感染肝细胞，导致其发生衰退的改变。随着胆结石数量及体积的增长，越来越多的细胞会受到感染及死亡，整个肝小叶开始崩溃，里面的血管开始变得扭曲。这对剩余肝细胞的血液循环产生重大的影响。这些变化对肝脏及其总体表现的破坏程度，很大部分决定于胆结石在肝导管里的堵塞程度。只有在多年不断加重的肝导管闭塞才会导致肝癌的发生。这种理论同样也适用于原发自胃肠道、肺及胸部的肝脏转移性肿瘤
大多数的肝炎（甲型、乙型、非甲型、非乙型）都是由一定量的肝小叶被胆结石堵塞而引起的，甚至有些人可以在很年轻的时候发病。如今普遍的临床实践中，过早地切断或钳断连接新生儿和母体的脐带，会让新生儿只剩下身体所需的三分之二的血容量，在小儿出生的一小时内，许多毒素会正常地通过胎盘滤出到体外，这时他们体内是几乎没有抗体的保护。脐带完全停止抽痛通常至少须40—60分钟，过早切断脐带是一种医疗上的疏忽行为，使婴儿的肝脏健康从一出生就受到影响，甚至会让他们早在童年时期就在体内形成胆结石，随之导致肝脏的感染。
健康的肝脏及免疫系统可以完全地破坏病毒物质，无论这些物质是来自于外环境的还是从其他途径进入到血液里的。大多数的人在这些病毒环境中是不会生病的。事实上，现在我们的体内存在大多数体外环境里的病毒。然而，当大量的胆结石在体内形成以后，肝脏会被阻塞及中毒，从而成为了有利于病毒活动的环境。病毒是一种进入寄主细胞内，利用其细胞物质和机能来生成新的病毒微粒的细胞寄生物（还有证据证明病毒可由细胞内的细菌繁殖而来）。但是病毒并不会无缘无故地在细胞里生长或攻击细胞。与我们一般的看法相反的是，病毒通常会“劫持”那些最衰弱和被破坏得最严重的细胞来防止它们发生突变。然而并不是所有的病毒都能成功发挥这项功能，肝癌还是可能发生的。因此在癌细胞里含有的病毒并不应被误解为有致癌的效果。
胆结石里包含着大量的活性病毒。其中一些病毒可从结石里释放进入到血液中。这就形成了慢性肝炎。肝脏的非病毒性感染可能是由胆管被胆结石堵塞释放出来的细菌引起的（并不是导致）。
胆结石存在于胆管里也会妨碍肝细胞处理毒性物质的能力，例如是三氯甲烷、细胞毒性的药物、合成代谢类固醇、酒精、阿司匹林、真菌、食物添加剂及诸如此类的物质。当发生这种情况时，机体会对这些可预料的和其他不可预料但包含在很多医疗药物中的毒性物质产生高度的敏感性。很多的过敏疾病就是起源于这些高敏反应。出于同样的原因，胆结石还可能加剧摄入的医疗药物的毒性副作用，这些副作用可能连（美国的）食品及药物管理局或医药公司都没有觉察到。
消化系统功能紊乱（6）
最觉见的一种黄疸病是由胆结石堵塞通向十二指肠的胆管和、或胆结石及纤维组织使肝小叶的结构变形而形成的。肝汁在肝汁通道（窦状隙）里的流动被封锁，肝细胞就不能再合成及分泌胆色素，即胆红素。随之，胆汁及其合成的物质将会在血流里积聚。当胆红素在血液里积聚时，皮肤就会被染色。当血液里的胆红素含量超过正常量的三倍以上，皮肤及眼结膜会出现明显的黄染。非结合胆红素对脑细胞有毒性作用。由胆管堵塞所致的胰头癌也会导致黄疸病的发生。
胆囊及胆管疾病
肝脏分泌的胆汁，通过两条肝管分支汇入肝总管中。肝总管距离与胆囊相连的胆囊管约英寸。经过胆总管以后肝胆汁继续流向肠道，但多数都先得通过胆囊。胆囊是从胆管突出的梨形袋状的器官，附着在肝脏的后面（如图5所示）。
正常的胆囊里通常含有2盎司液体状态的胆汁。然而，储存在胆囊里的胆汁，与肝脏里的胆汁浓度有所不同。在胆囊里，胆汁里的大多数盐质跟水份都被重吸收了，因此其容量会减少到仅仅是原来的量的十分之一。胆盐（相对于普通的盐）是不被重吸收的，这意味着它们的浓度呈十倍的增长。另外，胆囊分泌的黏液加入到胆汁里，使其变得像黏液一样地浓稠。胆汁的高浓缩性让其具有强大的辅助消化的能力。
当酸性及大多数的蛋白质食物从胃进入到十二指肠时，胆囊的肌壁会受到刺激而收缩分泌胆汁。值得注意的是，如果进入十二指肠的食物含有高比例的脂肪，胆囊活动则更加明显。机体利用胆汁中的胆盐乳化脂肪使其更加容易被消化。这些胆盐完成了它们的工作以后会继续流向肠道，而乳化的脂肪将在肠道中被吸收。这些被利用过的胆盐会被小肠末段（回肠）重吸收并被带回肝脏。那时，胆盐会再次被收集在胆汁里分泌到十二指肠中。肠道的堵塞会急剧地减少胆汁合成及脂肪消化所需的胆盐数量。胆汁中的胆盐浓度减低会导致胆结石的发生，并且使大量的脂肪物质不能被消化，这对人体整个的消化内环境来说是一场灾难。
胆囊中的胆结石主要是由胆固醇、钙质或像胆红素那样的色素合成的。胆固醇是最普遍的成份，但很多结石都是混合物。除了以上所说的组成部分，胆结石还可能含有胆盐、水份及黏液，还有毒性物质、细菌，偶尔还会有已经死亡的寄生物。
一般来说，结石在胆囊中不断增大长达约八年的时间，机体才会开始出现明显的症状。较大的结石通常会被钙化，因此能用放射学手段或超声学技术轻易地将其检测出来。但胆囊里85％的胆结石直径只有3/4英寸（如图6a所示），尽管有些会增大到2…3英寸（如图6b及图6c所示的被钙化的结石；在我妻子第九次应用肝清洗术毫无痛苦地排石以后，我私下检查及拍下了这些结石；它们会散发出一种莫名的毒性气味）。这些结石的形成是因为胆囊里的胆汁过于饱和、不能被吸收硬化而成的。
如果胆结石滑出胆囊压迫胆囊管或胆总管，它们的管壁会发生强烈的痉挛性收缩（如图3所示）。这样的收缩活动有助于将结石向前推。这会产生严重的疼痛，这就是胆绞痛，并且会伴发胆囊的相当程度的膨胀。如果胆囊里充满了胆结石，胆壁会发生痉挛性收缩而让人体遭受剧烈的疼痛。。 最好的txt下载网
消化系统功能紊乱（7）
胆结石会导致胆囊壁内膜的疼痛及感染，对胆囊管及胆总管也有同样的效果。这种情况被称为胆囊炎。还可能会发生微生菌的逐层感染。致使胆囊、十二指肠或结肠间的组织发生溃疡形成瘘管及纤维化粘连的现象很普遍。
胆囊疾病通常是起源于肝脏。肝胆管被胆结石堵塞后，最终会发展成纤维化组织使肝小叶的结构变形，门静脉的血压开始上升。从而导致从胆囊中运输静脉血到门静脉的胆囊静脉血压上升。胆囊中废物的不完全排泄会导致胆囊合成酸性废料，并阻塞在组织里。这会逐渐减低胆囊的耐力及正常功能的发挥。随之发生的，矿化结石的形成只是时间的问题了。
肠道疾病
小肠是胃部幽门括约肌的延伸，长约16…19英尺。它一直通向长度约为英尺的大肠。小肠分泌肠液完成对碳水化合物、蛋白质及脂肪的消化。它还负责吸收及供给机体所需的营养物质，及保护机体不受到那些逃过胃部盐酸抗菌屏障的微生物的感染。
当酸性食物（食糜）从胃部进入以十二指肠时，它们首先是跟胆汁及胰液结合。肝脏及胆囊里的结石大大地减少胆汁的分泌，使胰腺生物酶对碳水化合物、蛋白质及脂肪的消化能力大大削弱。从而使小肠不能正常地从这些食物中吸收有用的如营养成分（例如，碳水化合物中的单糖、蛋白质中的氨基酸、脂肪中的脂肪酸及甘油三醇）。这样的不完全吸收会导致营养不良及渴食症的发生。
胆汁是肠道吸收维持生命活动所必须的脂肪、钙质和维生素K必不可少的元素，因此，胆结石可以导致威胁生命的疾病，例如，心脏疾病、骨质疏松症及癌症。肝脏利用脂溶性的维生素K合成有凝血功能的化合物。如果维生素K吸收不足则会导致出血性疾病。如果体内存在脂肪吸收不良的问题，那么维生素K也不能被完全吸收。维生素K吸收不良的主要原因是机体内胆汁、胰脂肪酶、胰脂肪的供应不足。因此持续地进行低脂或无脂的饮食事实上是会危及生命的。
钙质是使骨头及牙齿保持硬度、凝血、肌肉收缩活动所必不可少的物质，因此，胆汁分泌过少，会削弱机体对进行维持生命所必需的活动所必需的钙质及矿物质的吸收能力，
维生素K的吸收机制对所有其他脂溶性维生素，包括维生素A、E、D也同样适用。只有在脂肪正常吸收的情况下小肠才能够吸收维生素A及胡萝卜素、如果维生素A的吸收量不足，组织上皮细胞会受到破坏。这些细胞是人体内构成所有器官、血管、淋巴管等必不可少的组成部分。维生素A同时也是维持双眼的健康及预防、减少微生物感染的重要元素。维生素D是骨头及牙齿钙化的必要成份（注：摄取充足的维生素D唯一真正安全的方法是来自于日晒和特定食物）。但很重要的是，我们必须意识到，简单的维生素补给是不能解决体内维生素不足的问题的。
总之，缺乏正常的胆汗分泌，机体是不能消化及吸收足够维生素的，从而会对循环系统、淋巴系统及排尿系统产生相当大的损害。
没有被充分消化的食物会在小肠和大肠里发酵、腐败、它们会吸引巨量的细菌来加速其分解过程。由此产生的分解产物及细菌的排泄物对人体都是非常有害的。所有这些会强烈地刺激肠道粘膜，而这也是机体对抗致病源的重要防线。这些毒素的入侵会破坏机体的免疫系统，而免疫系统60％的组成部分是分布在肠道里。不堪对抗这些毒素的持续性侵犯，小肠及大肠可能会产生许多的疾病障碍，包括腹泻、便秘、腹胀、克罗恩氏肠炎、结肠性溃疡、结肠憩室病、肠疝、肠息肉、痢疾、肠扭转、肠套叠，甚至还有良性或恶性肿瘤。
充足的胆汁循环保持机体对食物进行良好的消化吸收，并且对整个肠道有强力清洁的作用。机体的每一部分都依赖于消化系统提供营基础营养及有效地排出代谢废物。胆脏及胆囊里的胆结石极大地阻碍了这些极重要的生理过程的进行。因此，它必须对大多数（可能不是全部）使人体受到折磨的不同疾病负责。清除体内的胆结石可帮助使消化及排泄功能恢复正常，增进细胞的新陈代谢，保持机体平衡。
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循环系统障碍（1）
为了方便说明的关系，我将循环系统分为两个主要部分，分别是血液循环系统及淋巴系统。血液循环系统由发挥泵作用的心脏及承载血液流动的血管所组成。
淋巴系统由淋巴结及淋巴管所组成，淋巴管里有无色的淋巴液流动着。机体含有淋巴液的量是血液的三倍。淋巴液能携运代谢废物、细胞碎片并将其清除出体外。
淋巴系统是所有免疫细胞最主要的循环系统，这些细胞包括：巨噬细胞、T细胞、B细胞、淋巴细胞等等。通畅无阻的淋巴系统对机体保持强免疫力及动态平衡来说是非常必要的。
冠状动脉心脏病
心脏病比任何其他原因导致更多的美国人死亡。尽管心脏病发只是发生在一瞬间，但其实它是心脏隐匿性功能障碍多年来发展的最后阶段。而最常见的就是冠状动脉心脏病。在1900年以前，这种疾病虽然蔓侵了全部发达国家却鲜少致人于死，因此我们仍保持现代的生活方式，所有这些非天然的食物、不均衡的饮食习惯就是导致如今社会上心脏病多发的真正原因。然而，在心脏开始发生功能障碍以前，肝脏更早就已经失去了它大部分的活性及效能了。
肝脏影响整个循环系统，包括心脏。事实上，肝脏是心脏的最大保护者。在正常情况下，肝脏消毒及净化从腹部的消化系统、脾脏及胰脏流入门静脉的静脉血。除了降解酒精以外，肝脏还可以去除其他毒性物质，像微生物产生的毒素。它还可以杀死细菌和寄生虫，以及中和与特定功能的生物酶结合的某些药物的药性。肝脏一个最具特征的功能是去除含氮的氨基酸，因为氮不是合成新的蛋白质所需的物质。这些代谢物质是尿液素的化学成分。尿素从血流里分泌到尿液中。肝脏也有分解机体衰弱细胞的核蛋白质（细胞核）的功能。这个过程中产生的副产物尿酸，也会分泌到尿液中。肝脏每分钟过滤多于一夸脱的血液，使经过肝脏的排泄物质只剩酸性二氧化碳（如图7所示）。
经过肝脏的净化以后，血液经过肝静脉流入下腔静脉，然后直接进入到右心。静脉血从右心被带到肺脏，在那里发生气体交换：
血液吸收氧气同时排出二氧化碳。离开肺脏以后，被氧化的血液进入到左心，然后被泵入主动脉，为全身的组织供血。
肝胆管里的胆结石使肝小叶的基本结构变形。然后为这些肝脏单元供应血液的血管会发生痉挛，从而大大地减少血供。肝细胞因此被破坏，而有害的细胞碎片开始进入血流。这使肝脏消毒血液的能力更加受到削弱。结果，越来越多的有害物质滞留在肝脏及血液中。充血的肝脏会阻碍到时达心脏的静脉血，而导致心悸甚至是心脏病发。很明显地，那些没有被中和的毒素最终导致了对心脏及血管网络系统的破坏结果。
另一个在此发展过程中导致的结果是，那些来自死亡细胞（每天大约有300亿个细胞死亡）及那些食物中未被利用的蛋白质没有被充分降解，因此血液里的蛋白质聚集、含量增加。结果，机体尝试用血管基底膜来储存这些蛋白质。一旦超过了机体对蛋白质的贮存能力，所有新的蛋白质会滞留在血液里。这样会导致血红细胞的数量增加，使血容量增加到反常水平。同时，血液中聚集的血红素的量也开始上升，使皮肤、尤其是脸及胸部的皮肤潮红。（注意：血红素是一种在肺里与氧分子结合将其运输到全身细胞里的蛋白质复合物）。结果，血红细胞的体积会增大，大得不能通过细小的毛细血管网络。最终导致血液变得浓稠而流速缓慢，因此而加大其凝固的趋势（血小板粘在一起）。
循环系统障碍（2）
血凝块的形成被认为是导致心脏病发的最主要的危险因素。因为脂肪没有凝聚能力，所以危险的根源主要是来自血液里蛋白质的高度集中。研究人员发现，含硫磺基的氨基酸即高半胱氨酸，对小凝血块的形成有促进作用，从而开始对动脉造成伤害，甚至会灾难性地促进大多数的心脏病发作。我们需要知道的是，比起胆固醇升高，高半胱氨酸比正常量升高40倍的数据，对评估心脏疾病发作更有预言性。高半胱氨酸来自于氨基酸中的蛋氨酸的正常新陈代谢过程—蛋氨酸大量存在于红肉、牛奶及奶制品中。蛋白质的高度集中阻碍了对细胞持续需求性地分配重要的营养物质，尤其是水份、葡萄糖及氧份。在血液里存在过量的蛋白质同时也会导致血液脱水，也就是血液变浓稠—导致高血压以及心脏疾病的其中一个主要原因。更甚的是，这些蛋白质也会妨碍基础代谢产物的完全排泄。
所有这些因素综合起来迫使机体提升血压。这种情况也是我们所知道的高血压，它在某种程序上能减少血液浓稠带来的威胁生命的效果。它也允许足够的营养丰富的血液在充血状态的机体里循环。然而，这项机体对危害生命的情况发起的自救反应，却过度地压迫及损害血管。但是，比起用药物降血压时所产生的伤害后果这还算是比较好的。前沿的健康专家现在意识到，高血压药物是充血性心力衰竭及其他衰弱性疾病的主要原因之一。充血性心力衰竭是一个“慢性死亡”的进程，以致于完成每一个小动作、每一次呼吸及每说一句话都需要花费很大的力气，最后机体会变得连简单的功能也不能执行。
一个避免心脏病发的最初也是最有效的途径是，把多余的蛋白质从血液中清除出去，并暂时储存在其他位置上（如图8所示）。
血管网络是容纳大量蛋白质的唯一场所。毛细血管壁能够吸收大部份过量的、无用的、或无法使用的蛋白质。机体把可溶解的蛋白质转换成也是100％蛋白质的胶原纤维，并且将其储存在血管壁基底膜中。基底膜用来存在蛋白质的最大容量可使其增加到它原来厚度的八到十倍。在血管壁中储存着蛋白质也意味着机体不能正常地运输充分的氧份、葡萄糖及其他细胞必须的营养物质。这些被“饥荒”影响的细胞也包括组成心肌的细胞。其结果是心肌无力及心功能降低。这是退化引发退化性疾病的因素，包括糖尿病、纤维组织肌痛、关节炎和癌症。每当心脏受到影响时，整个身体都会遭受痛苦。
一旦毛细血管壁没有多余的空间可以容纳多余的蛋白质，动脉的基底膜就会开始捕获蛋白质。这一行为有利的效果是血液仍然是稀薄的，避免了心脏病猝发的危险，至少在一段时间内不会发生。然而最后，这个避免猝死危险的方法同时也会对血管壁造成损害（注意：只有那些更基础的机体自救机制才不会产生重大的副作用，如身体应急反应、感冒或腹泻）。动脉血管壁内膜变得粗厚，如同水管里生的锈一样。血管在不同的位置上出现破裂、伤口和病变。
血小板可以处理较小的血管侵害。这些极小的血液成分释放出血清素激素，可帮助收缩血管并减少出血。然而，对于那些较大的伤口，如那些典型的患病冠状动脉，不能单独靠血小板来治愈；它们需要机体更复杂的凝血过程来恢复。如果血凝块脱落，它能够进入心脏而导致心肌梗塞的发生，我们称之为心脏病猝发。若血凝块到达脑里则会发生中风。一旦血凝块进入到运输已使用过的血液的开放的肺动脉，这将是致命的。
循环系统障碍（3）
为了避免这样的危险发生，机体会启用一